Com os mesmos princípios que norteiam a Educação Infantil e o Ensino Fundamental, porém, enfatizando as peculiaridades próprias desta fase da escolaridade, o Ensino Médio do Colégio Mercedário Pio XII procura enfatizar e assegurar aos jovens a construção de sua identidade, não desprezando, porém, o preparo para o ingresso e continuidade de estudos no Ensino Superior, bem como a orientação para uma escolha profissional consciente.
A Educação Profissional é uma modalidade da Educação Básica e, como tal, busca o desenvolvimento de competências e habilidades requeridas pelo mundo do trabalho. Assim, as competências a serem desenvolvidas na formação profissional devem favorecer as exigências requeridas pelo mundo do trabalho e pela dignidade humana na perspectiva da vida plena. Os cursos técnicos e de qualificação são organizados, no Colégio Mercedário Pio XII, atendendo aos anseios do cidadão que busca sua formação profissional, aos princípios e valores da Escola, às necessidades do mundo do trabalho e às diretrizes estabelecidas para a educação nacional.